מטרתה של המכללה להכשיר אנשי חינוך רחבי אופקים, ערכיים ומשפיעים אשר יובילו רפורמות חדשניות ופרויקטים משמעותיים במערכת החינוך ובקהילה.
למכללת סמינר הקיבוצים שדרת ערכים מוסריים וחברתיים המהווים בסיס ויסוד לפעילותה בתחום החינוכי והחברתי: הומניזם, יושרה, דמוקרטיה, אחריות חברתית וסביבתית, רוחב דעת ועושר תרבותי, תרבות ישראל, איכות וחתירה למצוינות.